优化dNTPs浓度是提升PCR反应特异性和产量的关键。通常建议终浓度在50-200μmol/L之间,过低会导致扩增效率不足,过高则可能抑制Taq酶活性并增加错配率。
具体优化策略:
基础浓度设定:从50μmol/L开始尝试,这是平衡产量与特异性的安全起点。
浓度梯度测试:以50μmol/L为增量,在50-200μmol/L范围内设置梯度,通过电泳结果观察条带亮度与清晰度,选择最佳浓度。
浓度与模板匹配:长片段或复杂模板可能需要更高浓度(如200μmol/L)以确保足够的底物供应,但需警惕高浓度带来的非特异性扩增风险。
dNTPs质量:确保四种dNTP浓度均一,任何偏差都会导致错误掺入和反应提前终止。使用前可用NaOH将pH调至7.0,避免酸性环境影响反应。

注意事项:
高浓度dNTPs(>200μmol/L)会显著抑制Taq酶活性,务必避免。
低浓度(<50μmol/L)虽能提高忠实性,但会牺牲产量,需权衡。